31 января 2003 года Мавроди был арестован в Москве, на съемной квартире на Фрунзенской набережной, сотрудниками Главного управления уголовного розыска МВД РФ. При задержании у него был обнаружен поддельный паспорт на имя гражданина Юрия Зайцева, уроженца Санкт-Петербурга.
После ареста ему предъявили обвинения по двум статьям Уголовного Кодекса РФ: Организация подделки документов и Уклонение от уплаты налогов и (или) сборов с организации.